Speleológovia v Manínskom krase poznajú viac ako 50 prevažne menších puklinových jaskýň s ojedinelou kvapľovou - sintrovou výzdobou. Vznikli rozširovaním puklín v jurských a kriedových vápencoch vodou, ich zvetrávaním a rútením. Skoro všetky sú ťažko priechodné a majú do nich prístup iba jaskyniari. V bočnom hrebeni Veľkého Manína je ľahšie dostupná a verejnosti prístupná Partizánska jaskyňa (iný názov Hrubá diera).
Partizánska jaskyňa - Hrubá diera
Vznikla pôsobením vody a iných činiteľov v druhohorných vápencoch spodnej kriedy, ktoré majú vek skoro 130 mil. rokov. Partizánsku jaskyňu - v nadmorskej výške 784 m n. m. - tvorí priestranná tunelovitá klesajúca chodba v masívnych sivých vápencoch s rohovcami, ktorá sa končí v rozšírenom priestore. Má oblúkovitý vchod 3,3 x 2,7 m, dĺžku 21 metrov a miestami sa na stenách vyskytujú sintrové náteky.
Počas Slovenského národného povstania slúžila ako prechodný úkryt, ale je pravdepodobné, že človek ju využíval už skôr. Chodník k Partizánskej jaskyni v roku 2013 upravili a označili členovia Jaskyniarskeho klubu Strážovské vrchy v spolupráci s členmi KST Manín Považská Teplá. Je to odbočka žltej turistickej značky. O rok neskôr osadili pri vchode do jaskyne informačnú tabuľu.
Povyše nej v skalnom hrebeni sa nachádza skalné okno nazývané Oko a Vápencová jaskyňa, dlhá 140 metrov, tá však pre veľmi úzke priestory nie je prístupná verejnosti. Nižšie sú menšie jaskyne Plazivka a Komora. Väčšina jaskýň na Malom Maníne sa nachádza v oblasti tzv. Manínskeho Verdonu, známeho skôr horolezcom a skalolezcom. Okrem niekoľkých výnimiek nepresahujú dĺžku 10 metrov a sú prevažne bez sintrovej - kvapľovej výzdoby. Charakterizujú ich tesné a úzke puklinové priestory, viaceré sú ťažko prístupné. Týka sa to aj Malomanínskej jaskyne neďaleko vrcholu Malého Manína, dlhej 32 m, a Jaskyne neznámeho, najdlhšej (75 m) a najhlbšej (29 m) na Malom Maníne.
Najväčšie a významné priestory Manína
Najväčším jaskynným priestorom na oboch Manínoch je Jašteričia priepasť (Priepastná jaskyňa v Jašteričom hrebeni alebo Veľká jaskyňa) v nadmorskej výške 464 m n. m. Jej priepasťovitý vchod, ktorý zrejme vznikol prepadnutím časti povaly podzemnej dutiny, ústi po 10 metroch do pomerne veľkého dómovitého priestoru so stenami a stropom pokrytými mohutnými, už senilnými sintrovými útvarmi. Po zabezpečení otvoru proti pádu osôb do priepasti, osadení informačnej tabule, úprave a vyznačení odbočky z náučného chodníka by si mohli túto lokalitu pozrieť návštevníci Manínskej tiesňavy.
Za úvahu stojí aj predĺženie značkovaného chodníka vedúceho z Rozprávkovej lúčky na vyhliadku nad ňou až k neveľkej Jaskyni pod Černokňažníkom v Centrálnom (Lavínovom) žľabe. Malé jaskyne bez väčšieho turistického významu sa nachádzajú aj inde na Manínoch, na Bosmanoch a ešte dalej v Súľovských skalách. Výnimkou je jaskyňa Šarkania diera (590 m n. m.), vytvorená v karbonátových súľovských zlepencoch v masíve Roháča v Súľovských skalách. Má dĺžku 60 m, puklinový charakter a je verejnosti voľne prístupná - vedie k nej značkovaný chodník.
Historické osídlenie a ochrana
Bola osídlená už v kamennej dobe, okrem archeologických nálezov sa v nej našli aj kosti jaskynného medveďa, z čoho pochádza zrejme aj názov jaskyne (tieto kosti v minulosti pokladali za kosti drakov či šarkanov). Naše jaskyne sú prírodnými pamiatkami a verejnosti prístupné sú iba niektoré z nich. Zaslúžia si, aby sme krásy a vzácnosti v nich i v krase poznávali, obdivovali, ale aj chránili!
Región Horné Považie je známy množstvom jaskýň, ktoré sú sprístupnené pre verejnosť, niektoré je možné navštíviť v sprievode členov KST Pružina, prípadne je možné zúčastniť sa na niektorom z organizovaných koncertov v priestoroch jaskýň s veľmi dobrou akustikou. Jednou z najnánejších miestnych jaskýň je Pružinská Dúpna jaskyňa, ktorá sa nachádza neďaleko obce Pružina. Jej hlavnú časť tvorí priestranná chodba miestami široká 15 - 20 m s výškou 5 m. Nachádzajú sa tu kvapľové stalagmity, stalagnáty, sintrové náteky a útvary rozličných podôb. Jaskyňa je významným zimoviskom viacerých druhov netopierov.
Zákon č. 543/2002 Z. z. o ochrane prírody a krajiny v znení neskorších predpisov umožňuje voľný vstup bez sprievodcu do verejnosti voľne prístupných jaskýň, v ktorých nehrozí nebezpečenstvo poškodenia ich prírodných a kultúrnych hodnôt a je zaistený bezpečný pohyb návštevníkov. Podľa návrhov ŠOP SR, Správy slovenských jaskýň Krajské úrady životného prostredia doteraz vyhlásili 45 jaskýň za verejnosti voľne prístupné.
Okrem Jaskyne Partizánskej a ďalších jaskýň v Maníne sa spomínajú aj lokality v Strážovských vrchoch a Súľovských skalách, ktoré ponúkajú rôznorodé jaskynné miesta s turistickým alebo sprievodným prístupom. Pružinská Dúpna jaskyňa ponúka jedinečnú možnosť prejsť sa po podzemnej chodbe jednej z najstarších jaskýň na Slovensku. Mojtínska jaskyňa, Jaskyňa sv. V a ďalšie lokality v krasoch regiónu ponúkajú rozmanité krasové formy a prírodné krásy.
Turistické a ochranné odporúčania
Vo verejnosti voľne prístupných jaskyniach treba dodržiavať zákazy uvedené v § 24 zákona: nie je dovolené poškodzovať alebo ničiť horninové prostredie, biotopy živočíchov a ostatné zložky jaskynného ekosystému; zbierať nerasty, skameneliny, archeologické nálezy alebo paleontologické nálezy; chytať alebo usmrtiť živočíchy; vykonávať činnosť meniacu stav vodných tokov, jazier a miest presakovania zrážkových vôd; vykonávať technické geologické práce, banskú činnosť alebo činnosť vykonávanú banským spôsobom; skladovať alebo vyrábať priemyselné výrobky, poľnohospodárske produkty a iné materiály; táboriť, bivakovať alebo zakladať oheň; vpustiť alebo ustajniť hospodárske zvieratá alebo domáce zvieratá; organizovať telovýchovné alebo športové podujatie; znečisťovať podzemné priestory; rušiť pokoj a ticho; umiestniť stavbu; umiestniť reklamné alebo propagačné zariadenie.

Regionálne jaskyne sú skutočným pokladom, ktoré si zaslúžia ochranu a zodpovedný prístup verejnosti. Pri návšteve si návštevník uvedomuje historické významy jaskýň, ich ekologickú hodnotu a potrebu zachovania pre budúce generácie.
Ako sa podzemná voda pohybuje v krasovej krajine (krátka animácia)
Prehľad vybraných jaskýň a lokalít
- Pružinská Dúpna jaskyňa - verejne prístupná, hlavná chodba 15-20 m šírky, výška 5 m, kvapľové útvary a zimovisko netopierov.
- Partizánska jaskyňa (Hrubá diera) - 21 m dlhá, 3,3 x 2,7 m vchod, syntrové náteky, žltá turistická značka, informačná tabuľa v okolí.
- Jašteričia priepasť - najväčší priestor na Maníne, 10 m vchod do dómového priestoru s mohutnými sintrovými útvarmi.
- Jaskyne na Malom Maníne - Malomanínska jaskyňa (32 m), Jaskyňa neznámeho (75 m, 29 m hlboká).
- Šarkania diera - 60 m, verejnosti voľne prístupná, archeologické nálezy aj kosti jaskynného medveďa.